MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus fermentum CECT 5716 chromosome

Total Repeats: 18237

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017465	GCG	2	6	1	6	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017465	CA	3	6	203	208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017465	GTT	2	6	211	216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017465	T	7	7	286	292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017465	AGG	2	6	312	317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017465	CTA	2	6	1747	1752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017465	ACT	2	6	1755	1760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017465	TTA	2	6	1769	1774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017465	GGA	2	6	1793	1798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017465	GCCG	2	8	2984	2991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017465	AATTAA	2	12	2999	3010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017465	A	6	6	3068	3073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017465	A	6	6	3118	3123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017465	AAG	2	6	3174	3179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017465	AGA	2	6	3223	3228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017465	CAT	2	6	3232	3237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017465	GCT	2	6	3251	3256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017465	GAT	2	6	3302	3307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017465	GAA	2	6	3316	3321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017465	GTC	2	6	3347	3352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017465	GTT	2	6	3365	3370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017465	GAG	2	6	6477	6482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017465	ATTCT	2	10	9115	9124	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017465	ACG	2	6	9138	9143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017465	AGG	2	6	9192	9197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017465	TTAC	2	8	9230	9237	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017465	GAA	2	6	9256	9261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017465	CGA	2	6	9462	9467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017465	AGA	2	6	9519	9524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017465	GTA	2	6	9554	9559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017465	CGG	2	6	9671	9676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017465	CAG	2	6	9714	9719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017465	TCG	2	6	9753	9758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017465	CCA	2	6	9777	9782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017465	CGGA	2	8	9818	9825	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017465	TAA	2	6	9868	9873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017465	TGG	2	6	9880	9885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017465	AAC	2	6	9905	9910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017465	GGC	2	6	9911	9916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017465	AAC	2	6	9926	9931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017465	CTC	2	6	9987	9992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017465	AAT	2	6	9995	10000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017465	G	6	6	10004	10009	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017465	CAAC	2	8	10048	10055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017465	CCCAA	2	10	10081	10090	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
46	NC_017465	GCT	2	6	10139	10144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017465	GAC	2	6	10169	10174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017465	CGC	2	6	10177	10182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_017465	TCA	2	6	10244	10249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017465	AAAGA	2	10	10266	10275	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017465	ACT	2	6	10278	10283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017465	CAA	2	6	10312	10317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017465	CGT	2	6	10318	10323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017465	CGT	2	6	10330	10335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017465	CGC	2	6	10356	10361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017465	CGC	2	6	10474	10479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_017465	GC	3	6	10497	10502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017465	TGC	2	6	10517	10522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017465	AGA	2	6	10533	10538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017465	TAA	2	6	10549	10554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017465	A	6	6	10553	10558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017465	T	6	6	10585	10590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017465	TATGA	2	10	10615	10624	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017465	G	6	6	10654	10659	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017465	GGC	2	6	12818	12823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017465	GAA	2	6	12873	12878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017465	GCG	2	6	12882	12887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017465	AAG	2	6	12900	12905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017465	AGA	2	6	12911	12916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017465	GGC	2	6	13052	13057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017465	AGT	2	6	13144	13149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017465	C	7	7	13223	13229	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
73	NC_017465	AGA	2	6	13312	13317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017465	CTC	2	6	13343	13348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017465	CGAT	2	8	13386	13393	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017465	GTT	2	6	13394	13399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017465	CGC	2	6	13471	13476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_017465	CGG	2	6	13488	13493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017465	CGGCG	2	10	13536	13545	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
80	NC_017465	CCA	2	6	13560	13565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_017465	GGA	2	6	13647	13652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017465	GAA	2	6	13681	13686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017465	GTG	2	6	13687	13692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017465	GCC	2	6	13699	13704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017465	AGC	2	6	13728	13733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017465	ACA	2	6	13778	13783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017465	GAC	2	6	13785	13790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017465	ATC	2	6	13813	13818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017465	GGC	2	6	13821	13826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017465	CCGG	2	8	13827	13834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017465	CCGGT	2	10	13882	13891	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_017465	TG	3	6	13963	13968	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017465	G	6	6	13974	13979	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017465	ACC	2	6	13990	13995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017465	CGA	2	6	14078	14083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017465	CCG	2	6	14086	14091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017465	AAG	2	6	14133	14138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017465	TGATCG	2	12	14158	14169	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017465	CAA	2	6	14211	14216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017465	AAG	2	6	14244	14249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017465	G	6	6	14299	14304	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017465	CTT	2	6	14387	14392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017465	CGA	2	6	14399	14404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017465	TAC	2	6	14406	14411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017465	AAC	2	6	14419	14424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017465	AGG	2	6	14458	14463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017465	GAAGTC	2	12	14481	14492	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017465	ACT	2	6	14534	14539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017465	TAA	2	6	14543	14548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017465	ACA	2	6	14554	14559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017465	TGT	2	6	14654	14659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017465	GTTT	2	8	15872	15879	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017465	GGA	2	6	15951	15956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017465	CTA	2	6	15961	15966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017465	GCCA	2	8	15992	15999	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017465	CCA	2	6	16028	16033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_017465	ACG	2	6	16037	16042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017465	CCA	2	6	16148	16153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_017465	TTC	2	6	16261	16266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017465	ACA	2	6	16328	16333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017465	A	7	7	16384	16390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017465	CATGT	2	10	16491	16500	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017465	TTA	2	6	16512	16517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017465	A	6	6	16559	16564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017465	CCAC	2	8	16581	16588	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
126	NC_017465	GAA	2	6	16624	16629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017465	A	6	6	16632	16637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017465	GATG	2	8	16638	16645	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017465	GTT	2	6	16677	16682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017465	AGG	2	6	16729	16734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017465	GTC	2	6	16743	16748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017465	ACG	2	6	16756	16761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017465	TGC	2	6	16822	16827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017465	ATC	2	6	16884	16889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017465	CGA	2	6	16946	16951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017465	GCC	2	6	17011	17016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_017465	ACG	2	6	17041	17046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017465	CCG	2	6	17053	17058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_017465	TCA	2	6	17185	17190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017465	A	6	6	17278	17283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017465	CGG	2	6	17322	17327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017465	G	6	6	17326	17331	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017465	TAC	2	6	17337	17342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017465	GTG	2	6	21336	21341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017465	GAA	2	6	22228	22233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_017465	TGG	2	6	23764	23769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_017465	G	6	6	23837	23842	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017465	TTG	2	6	23888	23893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_017465	GCG	2	6	28145	28150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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274	NC_017465	T	7	7	39097	39103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_017465	AGTGA	2	10	39108	39117	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
276	NC_017465	AGTT	2	8	40506	40513	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
277	NC_017465	ACG	2	6	40539	40544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_017465	GTT	2	6	40624	40629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
279	NC_017465	GC	3	6	40702	40707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
280	NC_017465	T	6	6	40780	40785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_017465	GAG	2	6	40812	40817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
282	NC_017465	ATA	2	6	40825	40830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_017465	GA	3	6	40839	40844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
284	NC_017465	CCG	2	6	40866	40871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
285	NC_017465	TAA	2	6	40892	40897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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